A LUPER foi fundada em julho de 1943 em Lins, interior do estado de São Paulo, pelos farmacêuticos Lupércio Maciel, Roberto Alvarenga, Toshiaki Sakuda e João Sakuda. Nesta época, sua razão social era "Organização Farmacêutica LUPER Ltda."
O nome LUPER foi criado a partir de uma justaposição das primeiras sílabas do nome Luís Pereira, homenagem ao respeitado médico sanitarista Luís Pereira Barreto.
Neste início, a LUPER era ainda um comércio de produtos farmacêuticos, que também manipulava fármacos. Mas, aos poucos, com esforço e dedicação que sempre nortearam a empresa, foi se transformando em um respeitado laboratório farmacêutico.
Instalada por mais de 25 anos no bairro paulistano de Vila Mariana, o laboratório LUPER ainda passou pelo bairro de Pinheiros, antes de instalar sua fábrica em Atibaia e, por fim, em 1985, se transferiu definitivamente para Bragança Paulista.
Na sua atual instalação, a LUPER ocupa uma área total de 17.000 m², dos quais cerca de 9.900 m² compõem a planta industrial. Sua produção mensal de milhões de comprimidos, drágeas, cápsulas e centenas de milhares de frascos líquidos e suspensões, atendem a uma linha de mais de 100 medicamentos e apresentações.
A LUPER vem constantemente investindo na modernização dos maquinários, na ampliação da área construída, na melhoria do ambiente de trabalho e na valorização e treinamento de seus funcionários.
A linha industrial segue as especificações GMP (Good Manufacturing Practices), com rigoroso controle de qualidade, desde a análise das matérias primas até a expedição das embalagens. A sua unidade industrial conta ainda com uma estação geradora de nitrogênio e uma estação de tratamento de águas e efluentes próprias.
A atuação de uma eficiente equipe de supervisão de vendas e de representantes, atualmente, a LUPER atende hospitais, órgãos governamentais e mais de 16.000 farmácias e drogarias de todo o Brasil, com muita agilidade e rapidez, o que torna cada vez maior a participação da LUPER no mercado, conquistando cada vez mais a preferência de seus consumidores, a satisfação das farmácias e a confiança da classe médica.
Instalada a 80 km da cidade de São Paulo, em Bragança Paulista, uma das regiões mais privilegiadas pelo seu clima e pela qualidade do ar, a LUPER Indústria Farmacêutica possui 17.000 metros quadrados de área total e 8.500 metros quadrados de área construída.
Recentemente foi inaugurada uma nova área industrial especificamente para fabricação de produtos genéricos com capacidade inicial de 5 milhões de unidades.
A sua área para produção de injetáveis foi elaborada e projetada especificamente por uma empresa credenciada para construção de áreas limpas de acordo com as exigências da BPF (Boas Práticas de Fabricação).