A LUPER foi fundada em julho de 1943 em Lins, interior do estado de São Paulo, pelos farmacêuticos Lupércio Maciel, Roberto Alvarenga, Toshiaki Sakuda e João Sakuda. Nesta época, sua razão social era "Organização Farmacêutica LUPER Ltda."
O nome LUPER foi criado a partir de uma justaposição das primeiras sílabas do nome Luís Pereira, homenagem ao respeitado médico sanitarista Luís Pereira Barreto.

Neste início, a LUPER era ainda um comércio de produ-
tos farmacêuticos, que também manipulava fármacos. Mas, aos poucos, com esforço e dedicação que sempre nortearam a empresa, foi se transformando em um respeitado laboratório farmacêutico.

Instalada por mais de 25 anos no bairro paulistano de Vila Mariana, o laboratório LUPER ainda passou pelo bairro de Pinheiros, antes de instalar sua fábrica em Atibaia e, por fim, em 1985, se transferiu definitivamente para Bragança Paulista.
Na sua atual instalação, a LUPER ocupa uma área total de 17.000 m, dos quais cerca de 7.000 m compõem a planta industrial. Sua produção mensal de milhões de comprimidos, drágeas, cápsulas, injetáveis e centenas de milhares de frascos líquidos e suspensões, atendem a uma linha de mais de 100 medicamentos e apresentações.
A LUPER vem constantemente investindo na modernização dos maquinários, na ampliação da área construída, na melhoria do ambiente de trabalho e na valorização e treinamento de seus funcionários.
A linha industrial segue as especificações GMP (Good Manufacturing Practices), com rigoroso controle de qualidade, desde a análise das matérias primas até a expedição das embalagens. A sua unidade industrial conta ainda com uma estação geradora de nitrogênio e uma estação de tratamento de águas e efluentes própria.
Através da conexão "on line" da central administrativa em São Paulo com a unidade industrial e pela atuação de uma eficiente equipe de supervisão de vendas e de representantes, atualmente, a LUPER atende hospitais, órgãos governamentais e mais de 16.000 farmácias e drogarias de todo o Brasil e na América Latina, com muita agilidade e rapidez, o que torna cada vez maior a participação da LUPER no mercado, conquistando cada vez mais a fidelidade de seus consumidores, a satisfação das farmácias e a confiança da classe médica.
 
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